猪流行性腹泻在临诊症状、流行病学和病理变化等方面均与猪传染性胃肠炎无明显差异，只是猪流行性腹泻死亡率较猪传染性胃肠炎低，在猪群中传播的速度也较缓慢些。
根据临诊症状、流行病学、病理变化进行确诊是十分困难的，须进行实验室诊断。
目前，诊断方法有免疫电镜、免疫荧光、间接血凝试验、ELISA、RT-PCR、中和试验等，其中免疫荧光和ELISA是较常用的。
1、免疫荧光(immunofluorescence，IF) 用直接免疫荧光法(FAT)检测猪流行性腹泻病毒是可靠的特异性诊断方法，目前应用最为广泛。
2、酶联免疫吸附试验(ELISA) ELISA最大的优点是可从粪便中直接检查猪流行性腹泻病毒抗原，目前应用也较为广泛。
