慢性副伤寒由于发病特点、症状及剖检变化都较典型，不难做出诊断。
1、流行病学特点
仔猪副伤寒发生于1～3月龄仔猪，地方流行或散发，流行缓慢。常在饲养管理及卫生条件差的猪场发生。寒冷、气候多变、阴雨连绵季节多见发生；有降低仔猪抵抗力的多种致病应激因素存在。
2、临诊症状
初期急性发生时，与猪瘟、猪丹毒相似，需结合其他材料综合判断。慢性病例典型的症状是持续性下痢，呈慢性经过；部分仔猪还有肺炎症状。 imuyi.com
3、病理变化
大肠有典型的溃疡，或弥漫性坏死，肠壁变厚。肝、淋巴结等为干酪样坏死等。
4、细茵分离
急性病例需进行实验室检查，可从实质器官分离出病原菌，慢性病例不易成功。将分离的沙门氏菌，进行形态、培养特性(包括鉴别培养)、生化试验及血清学鉴定等。
5、鉴别诊断
急性病例与猪瘟、猪丹毒很相似，除了结合症状、病理及流行特点进行分析，综合判定外，尚需进行实验室检查(如对猪瘟进行猪瘟酶标抗体试验、猪瘟荧光抗体检验及猪瘟兔体交互反应等)。
