仔猪红痢的病原为C型产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens type C)，也称魏氏梭菌(C1、Welchii)。此菌革兰氏染色为阳性，是梭菌属中较长的大杆菌，长4～8µm，宽1～1、5µm，菌体短粗，两端钝圆，单个、成对或短链排列；本菌能形成芽孢，芽孢大于菌体的宽度，位于菌体中央或偏端，呈椭圆形，似梭状，故名梭菌。本菌无鞭毛，不能运动，在动物体内及含血清的培养基中能形成荚膜，是本菌特点之一。
本菌为厌氧菌，最适温度为37℃，在马丁氏血液琼脂平皿上，菌落呈圆形，边缘整齐，表面光滑、隆起，菌落周围有明显的透明β溶血环，其外围有不完全溶血区。在厌气肉肝汤中生长较快，如在37℃条件下培养2～3h即开始生长，肉汤呈均匀混浊，并产生大量气体。在葡萄糖鲜血琼脂表面厌氧培养生长的菌落，在25℃以上温度时，菌落与空气接触后可变成绿色，是其特征。
本菌能发酵葡萄糖、半乳糖、乳糖、麦芽糖、蔗糖、果糖，产酸产气。不发酵水杨素、卫芽醇、甘醇、鼠李糖。液化明胶，不产生靛基质，H2S阳性，MR和VP试验阴性。石蕊牛乳培养基的“爆裂发酵”，产生的大量气体使乳凝块变成多孔海绵状，甚至冲成数段或将试管棉塞冲出管外。
本菌能产生强烈的致死性毒素。根据产生的毒素不同可分为A、B、C、D和E 5个血清型。C型产气荚膜梭菌主要产生α、β毒素，特别是β毒素，它可引起仔猪肠毒血症和坏死性肠炎。根据毒素种类的不同，用以鉴定不同的菌型。
本菌广泛存在于自然界，通常存于土壤、饲料、污水、粪便及人、畜肠道中。梭菌繁殖体抵抗力并不强，一旦形成芽孢后，对热力、干燥和消毒药的抵抗力就显著增强。加热80℃ 30min、100℃ 数分钟可杀死本菌。
