猪感染乙型脑炎时，神经症状不如马发病时明显。猪常突然发病，体温升至40～41℃，呈稽留热，持续数日或10余天。病猪精神委顿、嗜睡，食欲减少或废绝；饮欲增加；粪干燥呈球状，表面附有灰白色黏液；尿呈深黄色；眼结膜潮红，心跳加快，呼吸稍快；有的可见有一过性的发热和精神、食欲不振的表现。
个别猪后肢呈轻度麻痹，步行不稳。也有的病猪因后肢关节肿胀、疼痛而发生跛行。个别表现神经症状，摇头，视力减弱，乱冲乱撞，后肢麻痹，最后倒地不起而死亡。
猪的乙型脑炎主要表现为妊娠母猪突然发生流产，在流产前只有轻度减食或发热，常不被饲养员发现；流产多发生在妊娠期，流产后体温、食欲恢复正常；少数流产母猪从阴道流出红褐或灰褐色黏液，胎衣不下。流产母猪对以后配种繁殖也无影响。
母猪发生流产，产出死胎、弱胎和木乃伊胎，流产胎儿的状态也是多样的，无一定的规律，我们可以看到不同妊娠阶段死亡的胎儿，小至拇指大，大到正常分娩胎儿一样，皮肤和脐带暗褐色，有不同过程的木乃伊死胎儿。
有的胎儿发育外观正常，但不能站立、不会吸乳；
有的生后1～5天出现癫痫样神经症状而死亡；
有的胎儿生长发育正常，生后能张口和伸动四肢，不久即死亡；
有的出生胎儿外观无多大异常，只是由于脑水肿而头部膨大2～3倍和腹水症死亡。
也可产出正常胎儿，在哺乳期生长发育良好。
病公猪病初出现高热和上述一般症状外，主要发生睾丸炎。睾丸肿大，多为一侧性，也有两侧性的。睾丸肿大的程度也不一致，一般大于正常的1倍左右。
患病睾丸阴囊皱襞消失，发亮，触摸时有热、痛的感觉。白猪睾丸皮肤发红。病猪睾丸约经3～5天后，肿胀可渐消退，恢复到正常状态，这种猪仍能配种。有的病猪睾丸缩小、变硬，性欲减弱，丧失产生精子的功能，失去繁殖能力而被淘汰。如仅一侧萎缩，仍有配种能力。
